Для тех, кто сталкивался уже с подобным заданием это не составит труда. Одна из стабильных версий Joomla (хоть и старая) и Virtuemart 1.1.5 , нужно сделать в магазине способ оплаты яндекс.касса.
вот тут максимально готовое решение, а также инструкция