Аудит архитектуры сервера

Существует сервер, на котором развернуты: около 20 веб сайтов (не очень нагруженных); почтовый сервер; ЦРМ (она самописная). 
Что нужно сделать: проанализировать аппаратную и программную части. 
Предпосылки к исследованию: 
В рандомные с точки зрения пользователя происходит зависание всех систем: сайт ЦРМ зависает, почта не обновляется, веб-сайты не загружаются. Симптом – повышенная нагрузка в докер-контейнерах.  + существует мнение что внутри можно (нужно) улучшить архитектуру. 

Ожидаемый результат: рекомендации по реструктуризации для повышения отказоустойчивости. При взаимопонимании – заключение на выполнение работ.

Что мы имеем: 
1) дедикейтед сервер, физический, не поделенный на виртуалки. Предоставлен российским хостером
2) сайты только php
3) Ubuntu 22.04.4
4) nginx+apache2
5) почтовик – mailcow, docker

Характеристики, конфигурация: 
2 x Xeon E5645 2.40 ГГц ; 
64Gb ; 
1 × 1920 Гб SSD + 1 × 2 Тб HDD SATA