На сайте есть родительская и дочерняя карточки товаров, созданные как отдельные карточки товаров (см. вложение), например:
Как выяснилось яндекс не понимает такую структуру и не индексирует дочерние товары.
Нужно сделать, сохранив верстку (так чтобы варианты опций отображались в таблице), используя модули опций