Исправить PHP скрипт/настройки сервера

Что нужно:
Исправить PHP скрипт/настройки сервера. Устранить проблему.

Кто нужен:
Нужен человек хорошо разбирающийся в веб программировании. Так же желателен опыт в настройке веб сервера Linux.

Суть работы:
Мною был поднят сервер PHP+Apache+MySQL+PhpMyAdmin, написаны PHP скрипты. В результате скрипты работают не корректно.
А именно – при выполнении скрипта, сервер забирает (использует) оперативную память и назад её не отдает (утечка памяти?).
Нужно понять из за чего это происходит, устранить эту проблему, дать краткие рекомендации.

С чем нужно работать:
Вся работа была выполнена мной. Все скрипты были написаны мной.
Скорее всего, работать нужно с одним скриптом.
Код в скрипте простой (переменные, массивы, циклы, работа с MySQL). 
50% кода в скрипте повторяющаяся (аналогичная).
Сервер Linux Debian. Всё (PHP+Apache) было установлено стандартно из официальных релизов/репозиториев.
Сервер "поднят" на виртуальной машине VMWare.

Чем я помогу:
Возможно общение по скайпу после 16.00 по Москве.
Готов объяснить каждую строчку скрипта, алгоритм работы, назначение входных данных.
Могу предоставить файл виртуальной машины для скачивания.

Дополнительная информация:
Ошибка (утечка памяти?) исчезает при перезапуске Apache-а.
Ошибка из за использования виртуальной (виртуализации) VMWare маловероятна т.к. подобная ошибка происходит и на реальном сервере во внутренней сети.

Пример файла (часть кода) во вложении.