Восстановление бухгалтерии для ИП

Ситуация такая: 
6 сентября 2013г. был зарегистрирован ИП, 
17 октября 2013 подано заявление о переходе на УСН, т.е. ошибочно (не учел срок подачи заявления после регистрации – 30 дней). 
Налоги c 2013г. платились по УСН, т.е. до 2014г. налоговая на УСН не переводила из-за срока подачи заявления, с 2014г. я на УСН, т.е. не верно сдана отчетность (УСН, а надо было с НДС) в 2013г.
20 января 2015г. налоговая прислала письмо с требованием разъяснений, на панике я сдал НДС за 2014-15г., что судя по документам было ошибкой.

Задача:
Проверить правильность сдачи отчетности за 2013-2015г.
Подготовить необходимые платежки и заявления с разъяснением ситуации для налоговой
Вернуть ошибочно уплаченный НДС

Какие инструменты имеются:
Эльба с ЭПЦ
Выписка с начала деятельности (16.10.2013г.)
Сканы документов (заявление перехода на УСН, письмо из налоговой и т.д.)

Жду ваших предложений по ценесрокам на данную задачу.